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RNA与膜的交联方法

发布时间:2023-09-05 20:06:40 人气:382 来源:析浦(上海)科学仪器

交联方法

将RNA固定在膜上有两种常用方法:烘焙或者紫外线交联。传统方法是将膜在80℃的烤箱中烘烤2小时,这种方法的缺点显而易见,耗时长且效率低。于是,更多的生物实验室开始使用紫外交联仪进行RNA的膜交联。相比传统的烘焙法,使用紫外交联仪仅需在254nm紫外光下照射几秒种即可,大大提高了实验效率!

一、传统烘焙法

烘烤的原理是加热膜以除去所有溶解RNA的水。RNA 的一个重要组成部分是其疏水性核苷酸碱基,它与膜上的芳香族基团进行疏水性接触。这种相互作用会受到在80°C烘箱中加热15分钟的影响。

这种传统方法耗时长,效率低。另外,如果不调节热量从而使温度升高至100°C,膜可能会损坏。因此,我们更推荐使用高效便捷智能的紫外交联法。

二、紫外线交联方法

短波紫外线使RNA中的含氮碱基(主要是尿嘧啶)变得高度活跃,并与膜表面的胺基形成共价键。潮湿的膜需要大约0.12J/cm2的紫外线照射量。析浦紫外交联仪XEPU-1208和XEPU-1215系列在出厂时均提供一个默认设置为0.12J/cm2的紫外线剂量,您可以一键使用这个默认值,实现“自动交联”功能。在操作时,注意不要将RNA暴露在紫外线下过少或过度,这两种情况都会降低杂交信号。我们建议,用析浦短波254nm紫外交联仪曝光一分钟,或用析浦中波302nm紫外交联仪曝光三分钟。您可以根据需要,自行设定照射能量或时间。

通过紫外线将RNA快速交联到膜上的实验步骤:

  1. 首先,制备具有5个相同泳道的凝胶,每个泳道包含1µg RNA。跑胶并将其转移到膜上。

  2. 然后,将膜切成相同的条,每条包含一条泳道。将它们单独包裹在单层塑料膜中。

  3. 将析浦紫外交联仪在干净干燥的水平面放置,并插上电源线。

  4. 请务必做好紫外防护措施。

  5. 打开析浦紫外交联仪的舱门,将条带放进析浦紫外交联仪的辐照室内,关闭舱门。

  6. 根据析浦科学仪器为您提供的操作指南,选取对应的操作模式,并在键盘上输入您需要的能量或时间值。

  7. 按下开始键,析浦紫外交联仪将启动照射,显示屏开始倒计时。

  8. 照射结束时,您会听到蜂鸣提醒,仪器将自动进入待机状态。

  9. 打开舱门,取出样品,关闭舱门。

  10. 使用完析浦紫外交联仪后,请务必断开电源。

析浦254nm短波8瓦紫外交联仪XEPU-1208:XEPU-1208析浦短波254nm紫外交联仪

析浦254nm短波15瓦紫外交联仪XEPU-1215:XEPU-1215析浦短波254nm紫外交联仪

下图:析浦254nm短波15瓦紫外交联仪XEPU-1215

析浦254nm短波15瓦紫外交联仪XEPU-1215替代进口

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